根据2009年2月5日　国税发〔2009〕10号《国家税务总局关于修改若干增值税规范性文件引用法规规章条款依据的通知》第七条第一款有关辅导期一般纳税人增购增值税专用发票按4％征收率计算预缴税款的规定，修改为按3％征收率计算预缴税款。。

各省、自治区、直辖市和计划单列市国家税务局：
　　《国家税务总局关于加强新办商贸企业增值税征收管理有关问题的紧急通知》（国税发明电〔2004〕37号，以下简称《紧急通知》）下发后，各级税务机关认真贯彻执行，取得了明显效果。同时各地也反映了一些问题，为了进一步做好新办商贸企业一般纳税人认定和增值税管理工作，现补充通知如下：
　　一、《紧急通知》第一条第（一）项所称新办小型商贸企业是指新办小型商贸批发企业。由于新办小型商贸批发企业尚未进行正常经营，对其一般纳税人资格，一般情况下需要经过一定时间的实际经营才能审核认定。但对具有一定经营规模，拥有固定的经营场所，有相应的经营管理人员，有货物购销合同或书面意向，有明确的货物购销渠道（供货企业证明），预计年销售额可达到180万元以上的新办商贸企业，经主管税务机关审核，也可认定其为一般纳税人，实行辅导期一般纳税人管理。
　　对申请一般纳税人资格认定的新办小型商贸批发企业，主管税务机关必须严格按照《紧急通知》和本通知的要求进行案头审核、法定代表人约谈和实地查验工作。对不符合条件的新办商贸批发企业不得认定为增值税一般纳税人。认定为一般纳税人并售发票后一个月内，税务机关要对企业经营和发票使用情况进行实地检查，提供服务，跟踪管理。
　　二、对新办小型商贸批发企业中只从事货物出口贸易，不需要使用专用发票的企业（以下简称出口企业），为解决出口退税问题提出一般纳税人资格认定申请的，经主管税务机关案头审核、法定代表人约谈和实地查验，符合企业设立的有关规定，并有购销合同或书面意向，有明确的货物购销渠道（供货企业证明），可给予其增值税一般纳税人资格，但不发售增值税防伪税控开票系统和增值税专用发票。以后企业若要经营进口业务或内贸业务要求使用专用发票，则需重新申请，主管税务机关审核后按有关规定办理。
　　出口企业在申请认定一般纳税人资格时，应向税务机关提供由商务部或其授权的地方对外贸易主管部门加盖备案登记专用章的有效《对外贸易经营者备案登记表》，作为申请认定的必报资料。
　　对认定为上述类型一般纳税人的新办出口企业，税务机关管理部门要在相关批文中注明不售专用发票，并将认定情况及时反馈给进出口税收管理部门。进出口税收管理部门应根据有关规定予以审核办理出口退税。
　　三、《紧急通知》第一条第（二）项所称注册资金在500万元以上，人员在50人以上的新办大中型商贸企业，提出一般纳税人资格认定申请的，经主管税务机关案头审核、法定代表人约谈和实地查验，确认符合规定条件的，可直接认定为一般纳税人，不实行辅导期一般纳税人管理。　
　　四、对已认定为增值税一般纳税人的新办商贸零售企业，第一个月内首次领购专用发票数量不能满足经营需要，需再次领购的，税务机关应当在第二次发售专用发票前对其进行实地查验，核实其是否有货物实物，是否实际从事货物零售业务。对未从事货物零售业务的，应取消其一般纳税人资格。
　　五、对新办工业企业增值税一般纳税人的认定，主管税务机关也应及时组织对纳税人的实地查验，核实是否拥有必要的厂房、机器设备和生产人员，是否具备一般纳税人财务核算条件。经现场核实，对符合有关条件的，应及时给予认定。不符合条件的不得认定。防止不法分子假借工业企业之名骗取增值税一般纳税人资格。
　　六、在2004年6月30日前已办理税务登记并正常经营的属于小规模纳税人的商贸企业，按其实际纳税情况核算年销售额实际达到180万元后，经主管税务机关审核，可直接认定为一般纳税人，不实行辅导期一般纳税人管理。
　　七、辅导期一般纳税人因需要增购增值税专用发票的，应先预缴税款。纳税人应依据已领购并开具的正数专用发票上注明的销售额按4％征收率计算，向主管税务机关预缴税款，同时应将领购并已开具的专用发票自行填写清单（格式见附件一），连同已开具专用发票的记帐联复印件一并提交税务机关核查。主管税务机关应对纳税人提供的专用发票清单与专用发票记帐联进行核对，并确认企业已经缴纳预缴税款之后，方可允许继续领购。
　　对辅导期一般纳税人发售发票时，须按以下公式计算本次发售发票数量：本次发售发票数量≤核定次购票量－本次申购票时结存发票数量。
　　八、对进入纳税辅导期管理的新办小型商贸企业不再实行原临时一般纳税人管理。
　　九、辅导期一般纳税人的增值税防伪税控开票系统最高开票限额原则上不得超过一万元，如果开票限额确实不能满足实际经营需要的，主管税务机关可根据纳税人实际经营需要，经审核，按照现行规定审批其增值税防伪税控开票系统最高开票限额和数量。
　　十、主管税务机关对申请一般纳税人资格的新办企业进行约谈或实地查验前，应及时通知纳税人，约谈或实地查验过程中，税务机关应当如实书面记录约谈和实地查验的内容及相关情况，存入审批档案。
　　十一、税务机关除要求新办商贸企业按照统一规定报送有关资料外，可结合本地区实际情况确定新办商贸企业申请增值税一般纳税人资格需报送的其它资料。
　　十二、失控发票电子数据按日上传及失控发票与认证发票的双向比对工作已于9月底在全国部署。
　　关于走逃户数据上报工作，各省级单位可通过浏览器（ie6.0及以上版本）访问总局网站（网址为：http://130.9.1.116/zthgl/login.asp）登录到走逃户数据上报系统。各省级单位的用户名及初始密码放置在总局技术支持网站（http://130.9.1.248）上，各地取得密码后应及时登录系统，将初始密码变更为自己的工作用密码并妥善保存。各地在使用过程中注意查看系统提供的使用帮助。
　　十三、《紧急通知》有关规定与防伪税控系统、征管软件相互衔接问题的解决方案，详见《防伪税控系统、综合征管软件操作流程》（附件二）。
　　十四、各地税务机关要按《紧急通知》和本通知要求，切实做好新办小型商贸企业一般纳税人认定和辅导期管理工作。对新办企业的申请，要认真负责地做好资料审核，实地查验和法定代表人约谈等审查工作，按规定区别不同情况处理，不要简单化，不搞一刀切。要切实加强辅导期管理和服务，尤其要抓住专用发票发售管理和对各种抵扣凭证先交叉稽核比对后抵扣等关键环节。要落实和运用好失控发票快速反应机制。要认真开展对近年来已认定为一般纳税人的小型商贸企业的检查，特别是对长期零负申报、大量运用海关进口缴款书和农副产品收购发票抵扣的企业重点检查，发现问题及时处理。要注意收集执行中发现的问题，并将开展的商贸企业一般纳税人认定检查工作与收集到的问题进行整理总结，形成正式报告，于2004年12月31日前上报总局流转税管理司和信息中心。附件一：增值税专用发票开具清单
企业名称（盖章）：　　　　　　　　税务登记号码：
序号 发票代码 发票号码 开票日期 金额 备注
　　　　　　
合计 -- -- -- 　 --

填表人（签字）：
填写说明：
　　1．《清单》按发票填开顺序填写；
　　2．发票分正数发票、负数发票和作废发票三类。正数发票金额前不需填写任何符号；负数发票金额前需填写“-”号；作废发票的开票日期、金额不需填写，备注栏内填写“作废”字样。合计金额填写正负数发票的余额。附件二：防伪税控系统、综合征管软件操作流程
　　一、防伪税控系统
　　（一）对小型商贸企业，其增值税防伪税控开票系统最高开票限额不得超过一万元，每次发售专用发票数量不得超过25份。
　　只需在对该企业所用的防伪税控系统开票用金税卡和ic卡发行时，设置发行信息中，将其“开票限额”设为“一万元”、“月购票限量”设为核定的该企业每次购票限量（最大为“25”份，以下简称核定数量）即可。
　　操作流程：
　　1、在系统管理中的“一般纳税人档案管理／企业发行信息管理”菜单中设置企业的发行信息，其中“开票限额”设为“一万元”、“月购票限量”设为核定数量。
　　2、通过企业发行子系统中“企业发行／初始发行”菜单，对企业的开票金税卡和ic卡发行即可。
　　（二）对商贸企业，每次发售专用发票数量不得超过25份，如果已领购的25份发票已用完，如何再次领购发票。
　　假定该企业的发票核定数量为25份，如果再次购票只需做“月购票限量”变更，每变更一次在原有数量基础上再增加25份即可。
　　操作流程：　
　　1、在系统管理中的“一般纳税人档案管理／企业发行信息管理”菜单中，月购票限量设为“原数量＋25”即可。
　　2、通过企业发行子系统中的“企业发行／变更发行／变更纳税人发行信息”操作，将已变更的月购票限量写入发行系统数据库。
　　3、在发票发售子系统中即可向该企业再销售