根据2007.07.26 国税函〔2007〕794号《国家税务总局关于增值税专用发票稽核系统（6．0版）运行有关问题的通知》本文自2007年7月26日起废止。
各省、自治区、直辖市和计划单列市国家税务局，局内各单位：
为提高增值税计算机稽核系统发票比对工作效率，缩短发票比对周期，加强税收征管，现将修订后的《增值税计算机稽核系统发票比对操作规程（试行）》印发给你们，自2004年6月1日起施行。《国家税务总局关于印发〈增值税计算机稽核系统发票比对操作规程（试行）〉的通知》（国税发〔2000〕208号）同时废止。这次修订的主要内容包括：
一、将征收机关采集发票存根联、抵扣联，区县级税务机关采集失控发票、纳税人档案变动情况数据时限提前到11日；地市级税务机关数据处理时限提前到13日；省级税务机关数据处理时限提前到14日；国家税务总局数据处理时限提前到16日。
二、取消区县级税务机关对专用发票存根联数据和抵扣联数据的采集和上传过程，改为地市级税务机关直接从防伪税控系统服务器将数据提入本地稽核数据库。
三、地市级税务机关、省级税务机关数据清分完成后立即上传异地发票等数据，然后再对本地发票数据进行比对。
各级税务机关应及时做好新规程的转发、宣传、培训工作，确保数据采集质量，减少操作失误。附件：增值税计算机稽核系统发票比对操作规程（试行）
第一章 总则
第一条 为了加强增值税计算机稽核工作的管理，保证增值税计算机稽核系统发票比对（以下简称发票比对）的正常运行，特制定本规程。
第二条 发票比对是税务机关利用计算机网络，将增值税一般纳税人（以下简称纳税人）申报认证的增值税专用发票（以下简称发票）抵扣联逐一与存根联进行核对（并把红字发票存根联与抵扣联进行核对）的增值税日常稽核管理手段。
第三条 发票比对实行两级数据采集、三级发票比对的五级管理。两级采集是指负有增值税直接征收职能的主管税务机关（以下简称征收机关）运用防伪税控报税子系统和认证子系统采集发票存根联和抵扣联数据，地市级税务机关将征收机关采集的发票存根联和抵扣联以及区县级税务机关采集到的其它数据传入稽核系统的过程；三级比对是指地市级税务机关、省级税务机关、国家税务总局（以下简称总局）三级分别对本地市、本省跨地市、跨省区域的发票进行比对。
第二章 数据采集
第四条 数据采集的内容包括：
（一）增值税防伪税控系统开具的发票存根联、抵扣联数据；
（二）失控发票数据；
（三）纳税人档案数据。
第五条 征收机关应于每月11日前（含当日，下同。若遇法定休假日的情况，比照征管法实施细则顺延规定的天数）完成以下工作：
（一）运用防伪税控报税子系统采集发票存根联数据，对未申报企业及时催报；
（二）运用防伪税控认证子系统采集发票抵扣联数据。
第六条 区县级税务机关增值税管理部门于每月11日前完成以下工作：
（一）录入失控发票数据；
（二）录入（或从其他计算机管理系统载入）纳税人档案变动情况数据（稽核系统初次运行前，将全部纳税人档案数据录入稽核系统）。
第三章 数据处理
第七条 区县级税务机关增值税管理部门于每月11日前统计、打印下列统计表：
（一）《失控发票明细表》；
（二）《增值税一般纳税人分类统计表》。
第八条 区县级税务机关信息中心于每月11日前将下列数据报上级税务机关：
（一）失控发票数据；
（二）纳税人档案变更情况数据。
第九条 区县级税务机关信息中心于每月12日前从地市级税务机关防伪税控系统服务器下载下列数据并提入本地稽核系统数据库：
（一）发票存根联数据；
（二）发票抵扣联数据；
（三）《增值税专用发票存根联采集情况统计表》数据；
（四）《增值税专用发票抵扣联认证采集情况统计表》数据。
第十条 区县级税务机关增值税管理部门于每月13日前统计、打印下列统计表：
（一）《增值税专用发票存根联采集情况统计表》；
（二）《增值税专用发票抵扣联认证采集情况统计表》。
第十一条 区县级税务机关信息中心于每月19日前从上级税务机关提取下列数据：
（一）相符发票数据；
（二）不符发票数据；
（三）缺联发票数据；
（四）抵扣联重号发票数据；
（五）属于失控发票数据；
（六）属于作废发票数据；
（七）红字缺联发票数据。
第十二条 区县级税务机关增值税管理部门于每月20日前统计、打印《增值税专用发票比对情况汇总统计表（含各级比对结果）》。
第十三条 地市级税务机关信息中心于每月12日前完成以下工作：
（一）将下列数据提入本地数据库：
1．发票存根联数据；
2．发票抵扣联数据；
3．《增值税专用发票存根联采集情况统计表》数据；
4．《增值税专用发票抵扣联认证采集情况统计表》数据；
5．失控发票数据；
6．纳税人档案变更情况数据。
（二）将提入本地数据库的数据进行以下处理：
1．将当月发票抵扣联数据与本地失控、作废发票数据库比对；
2．清分本、异地发票数据；
3．将下列数据报上级税务机关：
（1）异地发票数据
（2）《增值税专用发票存根联采集情况统计表》数据
（3）《增值税专用发票抵扣联认证采集情况统计表》数据
（4）失控发票数据
（5）纳税人档案变更情况数据
4．对本地发票数据进行比对。
第十四条 地市级税务机关增值税管理部门于每月13日前统计打印下列统计表：
（一）本规程第七条、第十条所列各类统计表；
（二）《增值税专用发票本级比对情况统计表》；
（三）《增值税专用发票本级比对不符详细情况统计表》；
（四）《上月协查结果返回统计表》。
第十五条 地市级税务机关信息中心于每月13日前将下列数据报上级税务机关：
（一）《增值税专用发票本级比对情况统计表》数据；
（二）《上月协查结果返回统计表》数据。
第十六条 地市级税务机关信息中心于每月18日前完成以下工作：
（一）从上级税务机关提取本规程第十一条所列比对结果数据；
（二）为下级税务机关准备本规程第十一条所列比对结果数据。
第十七条 地市级税务机关增值税管理部门于每月19日前统计、打印《增值税专用发票比对情况汇总统计表（含各级比对结果）》。
第十八条 省级税务机关信息中心于每月13日前完成以下工作：
（一）检查下级税务机关上报数据情况，对尚未报送数据的，应及时催报；
（二）将下级上报的数据提入本地数据库，并进行以下处理：
1．将当月发票抵扣联数据与本地失控、作废发票数据库比对；
2．清分本、异地发票数据；
3．将下列数据报上级税务机关：
（1）异地发票数据
（2）《增值税专用发票存根联采集情况统计表》数据
（3）《增值税专用发票抵扣联认证采集情况统计表》数据
（4）失控发票数据
（5）纳税人档案变更情况数据
4．对本地发票数据进行比对。
第十九条 省级税务机关流转税管理部门在每月14日前统计打印下列统计表：
（一）本规程第十四条所列统计表；
（二）《增值税专用发票本地比对情况统计表（含下级比对结果）》。
第二十条 省级税务机关信息中心于每月14日前将本规程第十五条所列各类数据报总局信息中心。
第二十一条 本规程第八条、第十五条、第二十条所称各级税务机关信息中心，应于上报数据前，确认流转税管理部门（增值税管理部门）完成所规定的统计工作。如遇有未完成统计工作情形的，信息中心予以督促。
第二十二条 省级税务机关信息中心于每月17日前，完成以下工作：
（一）从总局提取本规程第十一条所列比对结果数据；
（二）为下级税务机关准备本规程第十一条所列比对结果数据。
第二十三条 省级税务机关流转税管理部门于每月18日前完成统计打印《增值税专用发票比对情况汇总统计表（含各级比对结果）》。
第二十四条 本规程第十二条、第十七条、第二十三条所称各级税务机关流转税管理部门（增值税管理部门），应于统计、打印《增值税专用发票比对情况汇总统计表（含各级比对结果）》前，确认信息中心已完成从上级税务机关提取数据。如遇有未提取上级数据情形的，流转税管理部门予以督促。
第二十五条 总局信息中心于每月15日前完成以下工作：
（一）检查下级税务机关上报数据情况，对尚未报送数据的，应及时催报；
（二）将下级上报的数据提入本地数据库，并进行清分、比对处理。
第二十六条 总局流转税管理司于每月16日前统计、打印以下统计表：
（一）本规程第十四条所列统计表；
（二）《全国增值税专用发票比对情况汇总统计表（含各级比对结果）》。
第二十七条 总局信息中心于每月16日前为下级税务机关准备本规程第十一条所列比对结果数据。
第四章 附则
第二十八条 本规程由国家税务总局负责解释。
第二十九条 本操作规程自2004年6月1日起试行。原《增值税计算机稽核系统发票比对操作规程（试行）》（国税发〔2000〕208号）同时废止。
附件1：名词解释
一、失控发票指防伪税控企业丢失被盗金税卡中未开具的发票以及被列为非正常户的防伪税控企业未向税务机关申报或未按规定缴纳税款的发票。
二、作废发票指防伪税控企业通过防伪税控开票子系统予以作废的发票。
三、本地发票指购货单位、销货单位均属本主管税务机关所辖区域范围内的发票。
四、异地发票指购货单位、销货单位双方中只有一方在本税务机关主管范围内的发票。
五、清分指把下级上报的发票数据区分为本地发票和异地发票的数据处理过程。
六、相符发票指发票抵扣联与发票存根联的五要素相同。五要素包括：开票日期、购货单位纳税人识别号、销货单位纳税人识别号、金额合计、税额合计。其中抵扣联与存根联的金额合计、税额合计差异在1．00元内，系统按相符处理。
七、不符发票指发票抵扣联与发票存根联数据的开票日期、购货单位纳税人识别号、销货单位纳税人识别号、金额合计、税额合计五要素中存在不同。不符的优先级次序为：税额、金额、购货单位纳税人识别号、销货单位纳税人识别号、开票日期。
八、缺联发票指系统内有抵扣联而无存根联并且按规定不需留待下期继续比对的发票。
九、红字缺联发票指系统内有红字存根联而无红字抵扣联并且按规定不需留待下期继续比对的发票。
十、 抵扣联重号发票指系统内存在两份或两份以上相同发票代码和号码的发票抵扣联。
十一、滞留存根联指系统内有存根联而无抵扣联并且需要留待下期继续比对的发票。
十二、滞留抵扣联指系统内有抵扣联而无存根联并且按规定需要留待下期继续比对的发票。
十三、属于失控发票指在与全国失控、作废发票库比对中发现属于失控发票的抵扣联。
十四、属于作废发票指在与全国失控、作废发票库比对中发现属于作废发票的抵扣联。附件：2．增值税计算机稽核系统发票比对表证单书（略）
3．增值税专用发票稽核比对三级（地市、省、总局）工作图（略）(3)
各省、自治区、直辖市和计划单列市国家税务局，局内各单位：
为提高增值税计算机稽核系统发票比对工作效率，缩短发票比对周期，加强税收征管，现将修订后的《增值税计算机稽核系统发票比对操作规程（试行）》印发给你们，自2004年6月1日起施行。《国家税务总局关于印发〈增值税计算机稽核系统发票比对操作规程（试行）〉的通知》（国税发〔2000〕208号）同时废止。这次修订的主要内容包括：
一、将征收机关采集发票存根联、抵扣联，区县级税务机关采集失控发票、纳税人档案变动情况数据时限提前到11日；地市级税务机关数据处理时限提前到13日；省级税务机关数据处理时限提前到14日；国家税务总局数据处理时限提前到16日。
二、取消区县级税务机关对专用发票存根联数据和抵扣联数据的采集和上传过程，改为地市级税务机关直接从防伪税控系统服务器将数据提入本地稽核数据库。
三、地市级税务机关、省级税务机关数据清分完成后立即上传异地发票等数据，然后再对本地发票数据进行比对。
各级税务机关应及时做好新规程的转发、宣传、培训工作，确保数据采集质量，减少操作失误。附件：增值税计算机稽核系统发票比对操作规程（试行）
第一章 总则
第一条 为了加强增值税计算机稽核工作的管理，保证增值税计算机稽核系统发票比对（以下简称发票比对）的正常运行，特制定本规程。
第二条 发票比对是税务机关利用计算机网络，将增值税一般纳税人（以下简称纳税人）申报认证的增值税专用发票（以下简称发票）抵扣联逐一与存根联进行核对（并把红字发票存根联与抵扣联进行核对）的增值税日常稽核管理手段。
第三条 发票比对实行两级数据采集、三级发票比对的五级管理。两级采集是指负有增值税直接征收职能的主管税务机关（以下简称征收机关）运用防伪税控报税子系统和认证子系统采集发票存根联和抵扣联数据，地市级税务机关将征收机关采集的发票存根联和抵扣联以及区县级税务机关采集到的其它数据传入稽核系统的过程；三级比对是指地市级税务机关、省级税务机关、国家税务总局（以下简称总局）三级分别对本地市、本省跨地市、跨省区域的发票进行比对。
第二章 数据采集
第四条 数据采集的内容包括：
（一）增值税防伪税控系统开具的发票存根联、抵扣联数据；
（二）失控发票数据；
（三）纳税人档案数据。
第五条 征收机关应于每月11日前（含当日，下同。若遇法定休假日的情况，比照征管法实施细则顺延规定的天数）完成以下工作：
（一）运用防伪税控报税子系统采集发票存根联数据，对未申报企业及时催报；
（二）运用防伪税控认证子系统采集发票抵扣联数据。
第六条 区县级税务机关增值税管理部门于每月11日前完成以下工作：
（一）录入失控发票数据；
（二）录入（或从其他计算机管理系统载入）纳税人档案变动情况数据（稽核系统初次运行前，将全部纳税人档案数据录入稽核系统）。
第三章 数据处理
第七条 区县级税务机关增值税管理部门于每月11日前统计、打印下列统计表：
（一）《失控发票明细表》；
（二）《增值税一般纳税人分类统计表》。
第八条 区县级税务机关信息中心于每月11日前将下列数据报上级税务机关：
（一）失控发票数据；
（二）纳税人档案变更情况数据。
第九条 区县级税务机关信息中心于每月12日前从地市级税务机关防伪税控系统服务器下载下列数据并提入本地稽核系统数据库：
（一）发票存根联数据；
（二）发票抵扣联数据；
（三）《增值税专用发票存根联采集情况统计表》数据；
（四）《增值税专用发票抵扣联认证采集情况统计表》数据。
第十条 区县级税务机关增值税管理部门于每月13日前统计、打印下列统计表：
（一）《增值税专用发票存根联采集情况统计表》；
（二）《增值税专用发票抵扣联认证采集情况统计表》。
第十一条 区县级税务机关信息中心于每月19日前从上级税务机关提取下列数据：
（一）相符发票数据；
（二）不符发票数据；
（三）缺联发票数据；
（四）抵扣联重号发票数据；
（五）属于失控发票数据；
（六）属于作废发票数据；
（七）红字缺联发票数据。
第十二条 区县级税务机关增值税管理部门于每月20日前统计、打印《增值税专用发票比对情况汇总统计表（含各级比对结果）》。
第十三条 地市级税务机关信息中心于每月12日前完成以下工作：
（一）将下列数据提入本地数据库：
1．发票存根联数据；
2．发票抵扣联数据；
3．《增值税专用发票存根联采集情况统计表》数据；
4．《增值税专用发票抵扣联认证采集情况统计表》数据；
5．失控发票数据；
6．纳税人档案变更情况数据。
（二）将提入本地数据库的数据进行以下处理：
1．将当月发票抵扣联数据与本地失控、作废发票数据库比对；
2．清分本、异地发票数据；
3．将下列数据报上级税务机关：
（1）异地发票数据
（2）《增值税专用发票存根联采集情况统计表》数据
（3）《增值税专用发票抵扣联认证采集情况统计表》数据
（4）失控发票数据
（5）纳税人档案变更情况数据
4．对本地发票数据进行比对。
第十四条 地市级税务机关增值税管理部门于每月13日前统计打印下列统计表：
（一）本规程第七条、第十条所列各类统计表；
（二）《增值税专用发票本级比对情况统计表》；
（三）《增值税专用发票本级比对不符详细情况统计表》；
（四）《上月协查结果返回统计表》。
第十五条 地市级税务机关信息中心于每月13日前将下列数据报上级税务机关：
（一）《增值税专用发票本级比对情况统计表》数据；
（二）《上月协查结果返回统计表》数据。
第十六条 地市级税务机关信息中心于每月18日前完成以下工作：
（一）从上级税务机关提取本规程第十一条所列比对结果数据；
（二）为下级税务机关准备本规程第十一条所列比对结果数据。
第十七条 地市级税务机关增值税管理部门于每月19日前统计、打印《增值税专用发票比对情况汇总统计表（含各级比对结果）》。
第十八条 省级税务机关信息中心于每月13日前完成以下工作：
（一）检查下级税务机关上报数据情况，对尚未报送数据的，应及时催报；
（二）将下级上报的数据提入本地数据库，并进行以下处理：
1．将当月发票抵扣联数据与本地失控、作废发票数据库比对；
2．清分本、异地发票数据；
3．将下列数据报上级税务机关：
（1）异地发票数据
（2）《增值税专用发票存根联采集情况统计表》数据
（3）《增值税专用发票抵扣联认证采集情况统计表》数据
（4）失控发票数据
（5）纳税人档案变更情况数据
4．对本地发票数据进行比对。
第十九条 省级税务机关流转税管理部门在每月14日前统计打印下列统计表：
（一）本规程第十四条所列统计表；
（二）《增值税专用发票本地比对情况统计表（含下级比对结果）》。
第二十条 省级税务机关信息中心于每月14日前将本规程第十五条所列各类数据报总局信息中心。
第二十一条 本规程第八条、第十五条、第二十条所称各级税务机关信息中心，应于上报数据前，确认流转税管理部门（增值税管理部门）完成所规定的统计工作。如遇有未完成统计工作情形的，信息中心予以督促。
第二十二条 省级税务机关信息中心于每月17日前，完成以下工作：
（一）从总局提取本规程第十一条所列比对结果数据；
（二）为下级税务机关准备本规程第十一条所列比对结果数据。
第二十三条 省级税务机关流转税管理部门于每月18日前完成统计打印《增值税专用发票比对情况汇总统计表（含各级比对结果）》。
第二十四条 本规程第十二条、第十七条、第二十三条所称各级税务机关流转税管理部门（增值税管理部门），应于统计、打印《增值税专用发票比对情况汇总统计表（含各级比对结果）》前，确认信息中心已完成从上级税务机关提取数据。如遇有未提取上级数据情形的，流转税管理部门予以督促。
第二十五条 总局信息中心于每月15日前完成以下工作：
（一）检查下级税务机关上报数据情况，对尚未报送数据的，应及时催报；
（二）将下级上报的数据提入本地数据库，并进行清分、比对处理。
第二十六条 总局流转税管理司于每月16日前统计、打印以下统计表：
（一）本规程第十四条所列统计表；
（二）《全国增值税专用发票比对情况汇总统计表（含各级比对结果）》。
第二十七条 总局信息中心于每月16日前为下级税务机关准备本规程第十一条所列比对结果数据。
第四章 附则
第二十八条 本规程由国家税务总局负责解释。
第二十九条 本操作规程自2004年6月1日起试行。原《增值税计算机稽核系统发票比对操作规程（试行）》（国税发〔2000〕208号）同时废止。
附件1：名词解释
一、失控发票指防伪税控企业丢失被盗金税卡中未开具的发票以及被列为非正常户的防伪税控企业未向税务机关申报或未按规定缴纳税款的发票。
二、作废发票指防伪税控企业通过防伪税控开票子系统予以作废的发票。
三、本地发票指购货单位、销货单位均属本主管税务机关所辖区域范围内的发票。
四、异地发票指购货单位、销货单位双方中只有一方在本税务机关主管范围内的发票。
五、清分指把下级上报的发票数据区分为本地发票和异地发票的数据处理过程。
六、相符发票指发票抵扣联与发票存根联的五要素相同。五要素包括：开票日期、购货单位纳税人识别号、销货单位纳税人识别号、金额合计、税额合计。其中抵扣联与存根联的金额合计、税额合计差异在1．00元内，系统按相符处理。
七、不符发票指发票抵扣联与发票存根联数据的开票日期、购货单位纳税人识别号、销货单位纳税人识别号、金额合计、税额合计五要素中存在不同。不符的优先级次序为：税额、金额、购货单位纳税人识别号、销货单位纳税人识别号、开票日期。
八、缺联发票指系统内有抵扣联而无存根联并且按规定不需留待下期继续比对的发票。
九、红字缺联发票指系统内有红字存根联而无红字抵扣联并且按规定不需留待下期继续比对的发票。
十、 抵扣联重号发票指系统内存在两份或两份以上相同发票代码和号码的发票抵扣联。
十一、滞留存根联指系统内有存根联而无抵扣联并且需要留待下期继续比对的发票。
十二、滞留抵扣联指系统内有抵扣联而无存根联并且按规定需要留待下期继续比对的发票。
十三、属于失控发票指在与全国失控、作废发票库比对中发现属于失控发票的抵扣联。
十四、属于作废发票指在与全国失控、作废发票库比对中发现属于作废发票的抵扣联。附件：2．增值税计算机稽核系统发票比对表证单书（略）
3．增值税专用发票稽核比对三级（地市、省、总局）工作图（略）(3)